藥師寺作為法相宗的大本山，是「古都奈良文化財」的重要組成部分，並被列為世界文化遺產。據傳，該寺由天武天皇於天武皇9年為祈求皇后病癒而在飛鳥藤原京所建，並於平城京遷都後的養老2年（718年）遷至現址。

藥師寺是日本首座採用中央設置供奉本尊金堂的寺院，其獨特的「藥師寺式伽藍配置」以迴廊連接左右雙塔。寺內的「龍宮造」建築風格壯麗非凡，佛堂和塔的屋簷上裝飾著名為裳階的設計，使得屋簷層次看起來比實際上更多。藥師寺內保留了現存建築中唯一在奈良時代建造的東塔，以及本尊藥師三尊像等9件國寶，還有鎮守藥師寺的休岡八幡宮等26件重要文化財。值得一提的是，東塔於2021年完成了全面的解體整修，將1300年前的優美姿態重新呈現給世人。

全年藥師寺舉辦各類活動，如寫經講座、法話會及秋季特別拜觀，吸引了許多一般觀光客參加。在6月中旬至8月上旬之間，寺內的蓮花盛開，春季的櫻花和梅花也為這座古老的寺院增添了更多的美景。